После долгой службы в рядах армии США, ведущей военные действия в Афганистане, главный герой фильма «Дитя субмарины» — молодой парнишка Спенсер Кинг возвращается домой. Ему повезло вернуться с войны целым и невредимым, и парня можно считать настоящим счастливчиком, ведь он не раз видел гибель сослуживцев и друзей. Дома его радостно встречает семья и любимая девушка Эмили, а также многочисленные друзья, которым не терпится устроить другу веселую вечеринку в честь возвращения. Но мирная жизнь дома оказывается не так хороша, как хотелось.
Психологическое состояние Спенсера не стабильно, отношения с Эмили сильно портятся, друзья не совсем понимают его и кажется, что все вокруг какое-то чужое. Знакомство с милой девушкой Элис помогает Спенсеру отвлечься от своих проблем. Однажды она дает почитать Спенсеру комикс «Дитя субмарины», повествующий об уникальном мальчике, который научился по долг находится под водой, что привело к развитию уникальных способностей. Эта история помогает Спенсеру прийти в себя на время, но также приводит к драматическим событиям.