Членам специального подразделения G.I. Joe отдыхать некогда. Некая организация, именуемая «Коброй» снова замышляет недоброе. Дело в том, что она занимается незаконной торговлей оружием, а в мире из-за этого разгорается нешуточная война. Теперь элитный отряд должен положить этому конец. Но он оказывается между двух огней. С одной стороны, необходимо противостоять «Кобре», а с другой – возникает весьма серьезный конфликт с правительством. Теперь остается только гадать, как бойцы подразделения будут выбираться из этой непростой ситуации.